Los 4400 cuenta la historia de 4400 personas abducidas y desaparecidas durante varios años, tras su regreso a la Tierra. En palabras de los productores ejecutivos, es la historia de un grupo de gente que deben enfrentarse a cambios traumáticos, atormentados por el misterio de lo que les ha pasado y por qué. Algunos de ellos han sido infectados de forma misteriosa, logrando ciertas habilidades, tanto buenas como malas, por lo que parte de su drama será verles ajustándose a estos cambios que sufren en sus carnes.
Un cometa cambia su curso y se dirige a la Tierra desatando el pánico. Contra todo pronóstico no impacta sino que se posa sobre un lago dejando a 4400 personas que se creían muertas o desaparecidas.
Comienza a ser evidente que las 4.400 personas han regresado con una serie de poderes sobrehumanos, como el caso de Carl Morrisey, que se da cuenta de que su fuerza y sus reflejos son ahora mayores.
Tom y Diana son enviados para investigar un homicidio cuyo modus operandi parece ser el de un asesino en serie que nunca fue atrapado. El principal sospechoso es Oliver Knox, uno de los 4.400.
Los 4.400 son atacados con una serie de bombas incendiarias después de que Barbara Yates hiciera públicos sus nombres y direcciones. Mientras tanto Diana intenta ser una buena madre para Maia.
Tom monta en cólera cuando se entera de que Lyttel ha puesto a su hijo bajo custodia. A su vez, Richard comienza a sospechar que Collier está intentando controlar la vida de Lily.
Hace un año que volvieron los 4400. Después de un período de intensa observación médica, las vidas de los 4400 vuelven a la normalidad. Tom vuelve a trabajar para NTAC, y Diana adopta a Maia.
Hace un año que volvieron los 4400. Después de un período de intensa observación médica, las vidas de los 4400 vuelven a la normalidad. Tom vuelve a trabajar para NTAC, y Diana adopta a Maia.
Uno de los 4400 que posee poderes telepáticos, busca ayuda, pero en vez de ayudarle, el NTAC está más interesado en cómo su poder les puede ayudar a obtener información sobre Jordan Collier.
Uno de los 4400 vuelve después de 16 años de ausencia con un poder excepcional, puede incrementar la velocidad del metabolismo humano: podría esta forma de perder peso cambiar el mundo?
Después de 30 años de ausencia, una profesora de instituto vuelve con el poder de hacer que sus alumnos desarrollen un talento espectacular. Pero algunos de los padresdesconfían y se vuelven contra él.
NTAC está en alerta roja cuando Maia informa a Diana de que ha tenido una visión en la que Jordan Collier es asesinado. Mientras, Lily presenta Heidi a Isabelle y los problemas comienzan entre ellas.
Tom se despierta feliz, en un mundo paralelo, en el que nadie ha oído hablar de los 4400. ¿Decidirá quedarse allí o volver al otro mundo para descifrar los misterios de su vida pasada?
Tom y Diana investigan a uno de los 4400 que ha provocado una plaga que ha fulminado toda una población y cuyos poderes podrían acabar con la humanidad. April usa el poder de Maia para ganar apuestas.
Tom y Diana investigan a uno de los 4400 con la habilidad de curar cromosomas fetales dañados dentro del útero. Pero resulta que éste hombre es también el responsable de una masacre en una clínica.
NTAC sigue una serie de pistas que le lleva al asesino de Jordan Collier, y cuando Tom descubre que Kyle es el responsable, debe elegir entre la ley y su familia. Mientras, Danny mete en un lío a Liv.
Maia está enferma, y Diana la lleva a NTAC, donde uno de los 4400 ha lanzado una "bomba de cólera" que hace que los hombres se conviertan en monstruos agresivos. Shawn planea cambios para el Centro.
Algunos pertenecientes al grupo de los 4400 alrededor el mundo están desarrollando una enfermedad mortal y Dennis Ryland vuelve y anuncia la cuarentena tanto de los afectados como los no afectados.
Mientras los 4400 comienzan a morir debido a los efectos secundarios de la misteriosa enfermedad, Tom y Diana buscan desesperadamente una cura. Mientras, Kyle contempla la posibilidad de entregarse.
Richard se ve forzado a aceptar la repentina transformación de su pequeña hija en una mujer y un terrible cambio en su esposa, Lily. Mientras, Dennis es agredido durante un consejo.
Tom y Diana continúan buscando al Grupo Nova; La pequeña Maia comienza sus clases en el colegio del centro de los 4400. Isabelle descubre algo más sobre su papel en el futuro.
Tom Baldwin es arrestado por el NTAC por un crimen que no recuerda haber cometido; Shawn ayuda a Isabelle a descubrir las cosas que se ha perdido en la vida por su repentina edad adulta.
Tom y Diana intentan frustrar los planes de un secuestrador que persigue a niños de los 4400. Mientras, el pasado de Shawn vuelve para aterrorizarle.
Tom y Diana continúan la búsqueda del secuestrador que busca los niños de los 4400. La relación de Shawn con Isabelle no cae bien en el centro.
Shawn sufre un ataque a manos del Grupo Nova e Isabelle decide buscar venganza. Un miembro de los 4400 ofrece a Alana información sobre su pasado.
Tom y Diana cooperan con Dennis para encontrar a Navarro, miembro del grupo Nova, y descubren que alguien del centro de los 4400 le está ayudando.
Tom y Diana están drogados con una sustancia alucinógena, creada por uno de los 4400 que hace que se confronten a personas importantes de su pasado.
Tom y Diana descubren la investigación que Kevin Burkoff llevaba a cabo, y se dan cuenta de lo lejos que está dispuesto a ir para proteger su trabajo.
La investigación de Tom y Diana sobre una serie de asesinatos les lleva a descubrir otra conspiración dentro del Gobierno.
Tom espera probar la inocencia de su hijo encontrando a Jordan Collier, quien podría seguir vivo. Diana recibe una visita sorpresa de su hermana.
Tom y Diana sospechan de la implicación de Jordan en la fuga de miembros del NOVA. El compromiso de April se complica tras una predicción de Maia.
Tom y Diana continúan buscando a Jordan Collier, cuyo plan para la humanidad podría tener nefastas consecuencias. Dennis Ryland regresa a NTAC.
